根據對橋臂上MOS的PWM控制方式不同，分為三種控制模式：受限單極模式、單極模式、雙極模式。
受限單極模式
電機電樞驅動電壓極性是單一的。需要對一個MOS控制PWM控制。
優點：控制方式簡單。
缺點：不能剎車，不能能耗制動，在負載超過設定速度時不能提供反向力矩。調速靜差大，調速性能很差，穩定性也不好。
單極模式
電機電樞驅動電壓極性是單一的。需要對同一側橋臂的兩個MOS管進行互補PWM控制。要使用高級定時器的互補通道進行控制。
優點：啟動快，能加速，剎車，能耗制動，能量反饋，調速性能不如雙極模式好，但是相差不多，電機特性也比較好。在負載超速時也能提供反向力矩。
缺點：剎車時，不能減速到0，速度接近0時沒有制動力。不能突然倒轉。動態性能不好，調速靜差稍大。
控制過程：MOS管1和2由一對互補PWM進行控制，當1為高電平時，由VCC-1-Motor-4-GND形成通路，電機電流上升。當1為低電平時，2變為高電平，根據楞次定律，當不再給電機供電，線圈中存在自感電動勢，電流繼續往同一方向流動，于是由2-Motor-4形成通路，給線圈電流繼續提供通路。
于是線圈中的電流波形：
雙極模式
電樞電壓極性是正負交替的。需要兩組互補PWM同時對4個MOS管進行控制。
優點：能正反轉運行，啟動快，調速精度高，動態性能好，調速靜差小，調速范圍大，能加速，減速，剎車，倒轉，能在負載超過設定速度時提供反向力矩，能克服電機軸承的靜態摩擦力，產生非常低的轉速。
缺點：控制電機復雜，在工作期間，4個MOS管都處于開關狀態，功耗大。
控制過程：1和4同時處于PWM的高電平，于是由VCC-1-Motor-4-GND形成通路，電流上升。
當1和4同時變為低電平，2和3相應變為高電平，因為楞次定律，線圈上的電流方向不變，于是由GND-2-Motor-3-VCC形成通路，雖然存在反向的供電電壓，但是電機的線圈電流更大，于是電流仍然向VCC流動，同時電流下降的更快，線圈電流波動也更大。
電流波形：
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